Обнаружение колоний и подсчет клеток в колониях

Это приложение определяет количество клеток в плотно упакованной колонии, в которой трудно определить отдельные ядра.

Алгоритм определяет количество клеток, выделяя две клеточные популяции: одиночные клетки и многоклеточные колонии. Затем он использует среднюю интенсивность одной клетки, чтобы экстраполировать количество клеток, содержащихся в колонии.

• Измерение истинного количества клеток на колонию
• Метрики площади и плотности клеток
  Выделение формы и морфологии колонии
• Совместимость с изображениями в ярком поле